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Infinium OncoArray-500K BeadChip
一、芯片介绍
Infinium OncoArray-500K BeadChip是一款综合型强且密度性高的芯片,可用于癌症易感性检测及研究。
二、芯片特点
1)24样本OncoArray-500K芯片包含50万个SNPs,其中25万个标签SNPs,剩余SNPs位点来自于乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌、结直肠癌以及肺癌基因变异位点;还可以通过添加12万自定义位点让研究变得更具灵活性,可以方便更高密度靶定基因组的特定区域。
2)从五种常见癌症中优化选择出SNPs位点,是针对癌症检测和研究的高通量及高密度芯片。
3)该芯片内容在iCOGS芯片的基础上增加了结直肠癌和肺癌的SNPs位点信息,具有高通量和高准确性等优势。
三、服务内容
1. DNA抽提;
2. 样品质检:用琼脂糖凝胶电泳Thermo NanoDrop2000分光光度计对样品DNA进行质量检测和定量;
3. 实验过程:
a)扩增、片段化、杂交; b)洗脱、标记、染色;
4. 图像扫描:用Illumina iScan激光共聚焦扫描仪对杂交反应后的芯片进行扫描;
5. 数据处理:确定检出的SNP位点相应的核苷酸。